More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0413 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  91.34 
 
 		 259 aa  455  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  60.16 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 562 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 571 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.74 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.56 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.31 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.89 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.95 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  28.88 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.66 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.46 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.89 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.43 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.02 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.43 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  25.69 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.04 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.08 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>