More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0384 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.92 
 
 
319 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.52 
 
 
319 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.19 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.31 
 
 
322 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  55.35 
 
 
319 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.38 
 
 
335 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  57.1 
 
 
336 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.04 
 
 
320 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.04 
 
 
320 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.35 
 
 
319 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
319 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
335 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.06 
 
 
319 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
335 aa  345  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
331 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
325 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
321 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
324 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
321 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
319 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  39.06 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.57 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
318 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  39.12 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
326 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
321 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
321 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  41.88 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  38.49 
 
 
316 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
316 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
318 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
321 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  38.49 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  41.88 
 
 
318 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.88 
 
 
318 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.49 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  39.31 
 
 
324 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
318 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
331 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
306 aa  232  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
334 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
307 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
344 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
321 aa  228  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
321 aa  228  9e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
321 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
321 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
343 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
315 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.75 
 
 
315 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
321 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  41.56 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.74 
 
 
313 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
308 aa  225  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
321 aa  225  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
339 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
321 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
318 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
315 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
355 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
313 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
313 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.58 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.22 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  38.17 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
315 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
320 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
313 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
321 aa  217  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  36.05 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
319 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.98 
 
 
339 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
313 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
318 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  36.48 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.64 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.39 
 
 
339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  33.96 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>