More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0375 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  83.66 
 
 
306 aa  524  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  60.45 
 
 
325 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  51.77 
 
 
317 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  44.29 
 
 
313 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 
312 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 
293 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  42.01 
 
 
311 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 
299 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
308 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  41.79 
 
 
299 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
314 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
298 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 
318 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
324 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
705 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
327 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
306 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
308 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
324 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  31.71 
 
 
652 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
327 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
334 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
329 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
334 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
327 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
324 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
336 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.82 
 
 
297 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
334 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
360 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
305 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
313 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.52 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
289 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  28.31 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.83 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
310 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
303 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.32 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
714 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  35.91 
 
 
284 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
331 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
288 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  32.25 
 
 
884 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
317 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
318 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
300 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
305 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
310 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
342 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
312 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
315 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.68 
 
 
315 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
387 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
361 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
330 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 
379 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
340 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  32.69 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
314 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.73 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
307 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  30.63 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  28.46 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
326 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>