221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0337 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  679  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  86.9 
 
 
336 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  47.32 
 
 
337 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
318 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 
334 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.02 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
324 aa  85.5  1e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
337 aa  83.6  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
354 aa  82  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
335 aa  80.1  5e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.79 
 
 
348 aa  79.7  7e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 
324 aa  78.6  1e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
314 aa  78.2  2e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  27.46 
 
 
354 aa  76.6  6e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.2 
 
 
354 aa  76.6  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.71 
 
 
363 aa  75.5  1e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
317 aa  74.3  3e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
320 aa  73.9  3e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
323 aa  73.6  4e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
368 aa  73.6  4e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
345 aa  72.8  7e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.39 
 
 
317 aa  72.8  8e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  28.72 
 
 
317 aa  72.4  9e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
327 aa  72  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.05 
 
 
317 aa  72  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
349 aa  72  1e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
328 aa  72  1e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.05 
 
 
317 aa  72  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.07 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
317 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.16 
 
 
348 aa  71.2  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
324 aa  71.2  3e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
240 aa  70.9  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 
331 aa  70.9  3e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
344 aa  70.9  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
324 aa  70.5  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
339 aa  69.3  8e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.04 
 
 
317 aa  69.7  8e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
317 aa  69.3  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.28 
 
 
354 aa  68.9  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
332 aa  68.9  1e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 
324 aa  68.2  2e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
286 aa  67.4  3e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
332 aa  67  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
331 aa  67  4e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
287 aa  66.2  7e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 
341 aa  66.2  7e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
344 aa  65.5  1e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 
330 aa  65.5  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
231 aa  65.9  1e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
365 aa  65.9  1e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
231 aa  65.9  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.86 
 
 
352 aa  64.7  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
321 aa  65.1  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 
340 aa  63.9  4e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  25.45 
 
 
357 aa  63.5  5e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
325 aa  62  1e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  26.01 
 
 
307 aa  61.2  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 
352 aa  60.8  3e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 
329 aa  60.5  4e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 
322 aa  60.5  4e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
369 aa  60.5  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
359 aa  60.1  6e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  26.93 
 
 
359 aa  60.1  6e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
359 aa  60.1  6e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
359 aa  60.1  6e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
383 aa  60.1  6e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
359 aa  60.1  6e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
371 aa  58.5  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
246 aa  58.9  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
862 aa  58.2  2e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
321 aa  58.2  2e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.42 
 
 
207 aa  58.2  2e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.86838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 
350 aa  57.8  3e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 
329 aa  57.8  3e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 
359 aa  57.8  3e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  21.18 
 
 
310 aa  57.4  3e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
351 aa  57.8  3e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
331 aa  57  4e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 
323 aa  57  4e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
205 aa  56.2  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  5.49236e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
208 aa  56.2  8e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
363 aa  55.8  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
321 aa  55.1  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
357 aa  54.3  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
326 aa  53.9  3e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  23.51 
 
 
200 aa  53.9  4e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.47 
 
 
328 aa  53.5  5e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
384 aa  53.5  5e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.57 
 
 
278 aa  53.1  7e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 
241 aa  52.8  8e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  27.19 
 
 
359 aa  52.8  9e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  21.75 
 
 
343 aa  51.2  2e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  23.24 
 
 
354 aa  51.6  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
359 aa  51.6  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>