221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0337 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  86.9 
 
 		 336 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  47.32 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.02 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.79 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  27.46 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.2 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.71 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  28.72 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.05 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.05 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.16 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.07 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.04 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.28 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.86 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  25.45 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  26.01 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  23.55 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  26.93 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.42 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  21.18 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  23.97 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  23.51 
 
 		 200 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.57 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  27.19 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  23.24 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>