More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0314 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  72.22 
 
 
129 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  61.9 
 
 
148 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  50 
 
 
161 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.45 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0977  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.52 
 
 
134 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.96 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.52 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.64 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.75 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.33 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.9 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  39.68 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.48 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.13 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.39 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.29 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  35 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.13 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.28 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  34.38 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  34.38 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.06 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.28 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  35.38 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  33.58 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.4 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.88 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.13 
 
 
286 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.96 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  36.8 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.04 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  32.2 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  36 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.19 
 
 
284 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.83 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  35.29 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  34.45 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  34.85 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  34.45 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  36.13 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.19 
 
 
284 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.84 
 
 
290 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.48 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.5 
 
 
284 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  36.97 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.35 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.62 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.06 
 
 
344 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.07 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  35.83 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  36.97 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  35.83 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  33.61 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  34.85 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.58 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.92 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.4 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  32.5 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.82 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  36.13 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  33.61 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  33.83 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.19 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  35 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  34.45 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  35.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  33.33 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.33 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.88 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  35.71 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  33.88 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.25 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.77 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.59 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  35.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.53 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  35.29 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.3 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  32.77 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.3 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>