More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0268 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 587 aa  1107    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  86.37 
 
 		 586 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.31 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  40.63 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  41 
 
 		 621 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.34 
 
 		 608 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  42.7 
 
 		 502 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  46.47 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  41.36 
 
 		 501 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  33.17 
 
 		 641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.66 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  36 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  33.66 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 		 634 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  33.01 
 
 		 411 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.8 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  31 
 
 		 513 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.23 
 
 		 517 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 		 477 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  33.18 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.63 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  34.09 
 
 		 384 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 376 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  30.9 
 
 		 417 aa  94.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  31.6 
 
 		 405 aa  94.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 361 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.95 
 
 		 663 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 430 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 481 aa  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  30.49 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  32.35 
 
 		 541 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  32.33 
 
 		 380 aa  90.9  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  33.78 
 
 		 324 aa  90.5  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 388 aa  90.1  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 462 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.21 
 
 		 377 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  27.56 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  32.63 
 
 		 370 aa  87.8  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  32.63 
 
 		 370 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 		 432 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  32.63 
 
 		 370 aa  87.4  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 399 aa  87.4  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  87.4  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.87 
 
 		 400 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 		 448 aa  87  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  28.03 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 360 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.51 
 
 		 360 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.85 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 		 326 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.85 
 
 		 357 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  28.51 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  33.21 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.93 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.17 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  33.49 
 
 		 370 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0895  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  33.66 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  32.33 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  32.33 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  32.33 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>