90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0178 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  92.38 
 
 		 350 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  68.73 
 
 		 346 aa  448  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  60.31 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  35.93 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  30.89 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  32.39 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  29.52 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  28.79 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  28.36 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  29.76 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  29.11 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  29.62 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  28.37 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  30.43 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  27.24 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.71 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  30.11 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  27.34 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  30.22 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  28.29 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  30.22 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  25.41 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  29.28 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.87 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.51 
 
 		 386 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  29.04 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 586 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  26.51 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.35 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.96 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  26.27 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.39 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.24 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  27.12 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.65 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.51 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  28.83 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.42 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.71 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.42 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  23.1 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.13 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  22.86 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  22.64 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  32.26 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  26.67 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  38.1 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  24.01 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.17 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  23.78 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.94 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  22.48 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  25.19 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  27.13 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  23.96 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  21.93 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  24.38 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  22.3 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  19.46 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  29.46 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 613 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  28.11 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.65 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  26.47 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  29.67 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  29.96 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  22.99 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.21 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  30.36 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  30.36 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  24.12 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  26.28 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  38.81 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  26.84 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  26.35 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  38.81 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  29.46 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  27.61 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  23.73 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  24.46 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  24.22 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  34.74 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  23.66 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  25.59 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1773  hypothetical protein  32.43 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.600035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>