21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0157 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  690    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  79.13 
 
 		 346 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  32.65 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  32.65 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  31.56 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  26.3 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  28.53 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  25.95 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  26.1 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  23.84 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  26.84 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  28.94 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  24.86 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  24.93 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  28.96 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  27.81 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  26.32 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  25.29 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  24.79 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  25.74 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  25.9 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>