46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0153 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  89.06 
 
 		 325 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  64.12 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  59.94 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  45.97 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  34.66 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  29.69 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  28.75 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  35.22 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  34.74 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  36.36 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  30.45 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  36.33 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  27.5 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  28.37 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  26.83 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  29.64 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  30.83 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  29.34 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  29.65 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  27.94 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.34 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  26.3 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.69 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.67 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  27.8 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  32.25 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.1 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  24.21 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  27.9 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  29.58 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  29.26 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.48 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.18 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  34.51 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.8 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.47 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  23.85 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  26.92 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  22.98 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  26.04 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  26.13 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.37 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>