74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0141 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  36 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
1082 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
507 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  32.74 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
415 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  40.54 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
511 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  29.32 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  31.15 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
322 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
1476 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  31.46 
 
 
668 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  41.38 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
866 aa  48.5  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
810 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  30.67 
 
 
189 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  28 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  37.5 
 
 
870 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
1106 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  32.47 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  30.34 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
711 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.6 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
710 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  42.59 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.65 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  34.55 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  32.95 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7379  SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  30.49 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  52.5 
 
 
359 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.96 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
216 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
281 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
237 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
275 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
252 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.8 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.8 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>