119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0134 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  78.89 
 
 
227 aa  318  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  55.39 
 
 
203 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  55.1 
 
 
202 aa  208  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  55.61 
 
 
203 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  53.12 
 
 
203 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  52.02 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  51.01 
 
 
218 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  50.78 
 
 
203 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  49.47 
 
 
207 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  37.7 
 
 
201 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  35.12 
 
 
182 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  36.13 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  35.67 
 
 
187 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  38.52 
 
 
183 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  42.14 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  40.71 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  35.37 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  36.29 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  37.18 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  39.85 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  38.57 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  33.11 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  35.1 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  34.48 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  34.53 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  40.71 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  35.85 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.14 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.03 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  33.13 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  39.01 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  41.13 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  34.72 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  34.62 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  28.03 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  32.41 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  34.06 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  35.46 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  30.07 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  38.13 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  33.1 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  36.59 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  32.82 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  31.76 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  32.85 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  34.46 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  35.56 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  35.17 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  31.03 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  32.96 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  36.62 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  34.01 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.94 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.13 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  31.29 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  30.3 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  29.61 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  29.75 
 
 
245 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.1 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  28.66 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  30.54 
 
 
195 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  29.79 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  26.17 
 
 
188 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.16 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  31.34 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0580  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  38.36 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  32.67 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  29.34 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  27.71 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  26.5 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  35 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  25.43 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  26.83 
 
 
187 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  30.14 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3259  protein of unknown function DUF820  35.38 
 
 
242 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00168542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  24.82 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>