47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0102 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  78.26 
 
 		 115 aa  186  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  36.21 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1743  hypothetical protein  43.24 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  30.63 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  30.63 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  41.82 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  40.18 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  37.72 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  35.96 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  35.54 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  28.43 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  31.9 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  33.91 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  44.58 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  34.82 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  36.79 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  28.44 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  29.09 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 323 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  31.19 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  29.17 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  32.43 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  29.13 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  26.17 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  27.88 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  33.73 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  28.28 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  36.47 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45240  predicted protein  26.77 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.169462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  29.2 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  30.77 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  29.06 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  31 
 
 		 115 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  41.77 
 
 		 374 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  28.18 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  25 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  27.03 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>