More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0065 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
365 aa  715    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  70.22 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 
705 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
699 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
258 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 
256 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1089  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 
316 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.149078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.04 
 
 
271 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.42 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.14 
 
 
267 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 
294 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
259 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.63 
 
 
251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
199 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
250 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  38 
 
 
335 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  31.98 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.93 
 
 
299 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.18 
 
 
244 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 
260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  32.11 
 
 
260 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 
260 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 
260 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
228 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 
260 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.11 
 
 
260 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
263 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 
344 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
242 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  29.85 
 
 
235 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
251 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  31 
 
 
299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 
299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
281 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
337 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 
405 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
241 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
299 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
299 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 
352 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  39.85 
 
 
217 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
299 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
299 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
295 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  40.15 
 
 
212 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 
542 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
299 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.86 
 
 
250 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
368 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  28.69 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
465 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
276 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 
404 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.69 
 
 
265 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 
255 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.69 
 
 
299 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.99 
 
 
373 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  30.2 
 
 
265 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 
309 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 
215 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 
275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 
258 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 
264 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
227 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.39 
 
 
254 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
254 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  31.63 
 
 
258 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  30.39 
 
 
254 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
249 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
221 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.39 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>