145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0046 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  92.6 
 
 		 530 aa  1033    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 530 aa  1102    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  74.67 
 
 		 539 aa  862    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  38.29 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 467 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 443 aa  362  6e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 433 aa  362  9e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 490 aa  362  1e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  50.14 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 459 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 463 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 462 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  46.26 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 468 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 462 aa  343  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3146  glycyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 467 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 467 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 460 aa  326  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 462 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 462 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 509 aa  312  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 463 aa  309  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 489 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 489 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 497 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 496 aa  286  8e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 456 aa  280  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>