More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0045 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
399 aa  823    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.48 
 
 
404 aa  793    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.85 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.11 
 
 
383 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.97 
 
 
384 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.97 
 
 
384 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  68.23 
 
 
384 aa  547  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.71 
 
 
384 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.84 
 
 
384 aa  534  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  67.02 
 
 
399 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  63.87 
 
 
382 aa  531  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.54 
 
 
383 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  64.69 
 
 
418 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  64.51 
 
 
384 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  59.84 
 
 
390 aa  513  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  60.77 
 
 
417 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  60.26 
 
 
418 aa  484  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.97 
 
 
382 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  50.51 
 
 
395 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  44.04 
 
 
388 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  46.49 
 
 
384 aa  354  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 
401 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  46.98 
 
 
406 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  43.97 
 
 
456 aa  331  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  45.66 
 
 
406 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.72 
 
 
404 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 
398 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.86 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.52 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  46.46 
 
 
404 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  46.04 
 
 
391 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 
406 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  43.44 
 
 
401 aa  309  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  43 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  43 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.49 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.8 
 
 
398 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  41.15 
 
 
398 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.77 
 
 
397 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.77 
 
 
397 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.15 
 
 
397 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.94 
 
 
397 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.9 
 
 
397 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.4 
 
 
397 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.4 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
389 aa  285  7e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  38.67 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
390 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  44.57 
 
 
361 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  44.57 
 
 
361 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  45.16 
 
 
361 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
382 aa  250  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  27.15 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
323 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  27.74 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  36.92 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  32.1 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
680 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  28.77 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  35.1 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
327 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
285 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
321 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
312 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  34.44 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
373 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  27.76 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  37.69 
 
 
373 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  34.44 
 
 
337 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  34.44 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  31.13 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  26.02 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  30.67 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  31.13 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  26.93 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  33.77 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  33.08 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  33.57 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  27.05 
 
 
332 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  36.09 
 
 
336 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>