34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0033 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  89.57 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  80 
 
 		 115 aa  185  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  45.05 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  45.05 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  43.24 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  29.73 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  29.31 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  33.01 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  31.25 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  31.37 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  26.5 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  27.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  25.23 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1348  roadblock/LC7 family protein  26.36 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  29.52 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  28.45 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>