More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0001 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  89.79 
 
 		 481 aa  890    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 480 aa  986    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  66.39 
 
 		 478 aa  628  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  64 
 
 		 472 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.42 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.41 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.26 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  45.15 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  45.36 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  45.36 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  45.36 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  45.36 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  45.36 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.15 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  44.94 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.06 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  43.67 
 
 		 450 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.15 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  44.89 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.4 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.4 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  46.84 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.09 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  44.82 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  43.95 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.59 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  45.7 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.65 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  44.04 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.81 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.05 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.47 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  43.19 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.39 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.69 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  43.19 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  42.71 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  44.04 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  42.17 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.72 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.98 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.72 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.01 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  41.6 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  40.93 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 451 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 451 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.43 
 
 		 587 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  39.37 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.43 
 
 		 591 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  44.47 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.4 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  39.41 
 
 		 524 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  38.41 
 
 		 449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.65 
 
 		 458 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.2 
 
 		 468 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.22 
 
 		 566 aa  355  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  40.08 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.16 
 
 		 721 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.19 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  43.55 
 
 		 495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.31 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  43.55 
 
 		 495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  43.55 
 
 		 495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.26 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.55 
 
 		 527 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.76 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  40.34 
 
 		 462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  43.99 
 
 		 494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.47 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 		 464 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  53.53 
 
 		 597 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.89 
 
 		 464 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.44 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.46 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.44 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 462 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 462 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 462 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 462 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  39.71 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  40.71 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 		 462 aa  349  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>