More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1258 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  90.87 
 
 		 208 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  90.87 
 
 		 208 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  62.38 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  62.38 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  60.4 
 
 		 232 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  60.4 
 
 		 232 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.9 
 
 		 232 aa  240  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.69 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.17 
 
 		 207 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.19 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.91 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  61.2 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  60.87 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.03 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  55.33 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.61 
 
 		 201 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  56.61 
 
 		 201 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  58.7 
 
 		 203 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.24 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.2 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  56.08 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  48.79 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.78 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.22 
 
 		 207 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.31 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.81 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  54.84 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  54.3 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.58 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.26 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  54.79 
 
 		 201 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  50.5 
 
 		 203 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.75 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  51.58 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  51.35 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  51.58 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  49.52 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.77 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  51.05 
 
 		 203 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  50.79 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.42 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.95 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  51.34 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  49.75 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  47.78 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.89 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  51.56 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  51.56 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.62 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.09 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.09 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.03 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.88 
 
 		 182 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.63 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.47 
 
 		 237 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.5 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.47 
 
 		 237 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.47 
 
 		 237 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  48.63 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.47 
 
 		 237 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  48.47 
 
 		 237 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.47 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.47 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.87 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  47.78 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  45 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.63 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.03 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.45 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.5 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.23 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.5 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.9 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.5 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.51 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  47.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  47.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  45.73 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  46.97 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  45.18 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  47.74 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  47.74 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  47.74 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.58 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  45.1 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.15 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  44.88 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  44.88 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.15 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  45.1 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  45.1 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  47.24 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>