More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1179 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  100 
 
 
328 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  100 
 
 
328 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  82.01 
 
 
330 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  81.4 
 
 
330 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  68.63 
 
 
330 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
337 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
349 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  65.55 
 
 
337 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  63.9 
 
 
321 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  63.9 
 
 
321 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  63.9 
 
 
321 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  61.13 
 
 
325 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  61.13 
 
 
325 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  61.13 
 
 
325 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  56.79 
 
 
326 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  56.79 
 
 
326 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  56.79 
 
 
326 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  56.79 
 
 
326 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  56.07 
 
 
326 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  56.62 
 
 
338 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  56.97 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  54.8 
 
 
327 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  56.35 
 
 
327 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  54.83 
 
 
326 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  54.77 
 
 
330 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  55.66 
 
 
322 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  56.39 
 
 
331 aa  358  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  55 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  56.7 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  57.01 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  56.17 
 
 
329 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  55.35 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  55.03 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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