251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0963 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.21 
 
 
695 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0052  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  52.87 
 
 
701 aa  763    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.57 
 
 
893 aa  725    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.08 
 
 
708 aa  771    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  91.14 
 
 
687 aa  1297    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.309606  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.85 
 
 
704 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0963  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 
683 aa  1429    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.77 
 
 
710 aa  665    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.76 
 
 
816 aa  696    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.45 
 
 
730 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.98 
 
 
695 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0862  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.51 
 
 
698 aa  771    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.57 
 
 
690 aa  692    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
583 aa  963    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00137002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2642  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.44 
 
 
673 aa  1031    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.45 
 
 
721 aa  675    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2171  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.32 
 
 
676 aa  1016    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00664522  hitchhiker  0.00155539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  90.9 
 
 
683 aa  1312    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
583 aa  963    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3365  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.6 
 
 
675 aa  985    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.08 
 
 
685 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1239  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.7 
 
 
698 aa  783    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1276  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  74.47 
 
 
673 aa  1059    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.1 
 
 
705 aa  697    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  79.07 
 
 
596 aa  969    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0368  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.82 
 
 
675 aa  1030    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.34 
 
 
706 aa  636    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75.18 
 
 
627 aa  919    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75 
 
 
673 aa  1055    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.92 
 
 
686 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  76.04 
 
 
675 aa  1053    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4058  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.52 
 
 
707 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5139  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  82.73 
 
 
574 aa  1005    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2340  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  74.96 
 
 
591 aa  947    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855235  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.06 
 
 
669 aa  1039    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75.59 
 
 
636 aa  902    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1897  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.08 
 
 
700 aa  746    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000617448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.58 
 
 
718 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.92 
 
 
629 aa  904    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39690  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.64 
 
 
675 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.23 
 
 
719 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.05 
 
 
715 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.82 
 
 
813 aa  712    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.61 
 
 
692 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.85 
 
 
709 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0454  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.38 
 
 
703 aa  786    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000238531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.25 
 
 
676 aa  727    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.75 
 
 
689 aa  753    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.29 
 
 
581 aa  941    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.07 
 
 
800 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  90.99 
 
 
687 aa  1295    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.08 
 
 
730 aa  696    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.08 
 
 
701 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.85 
 
 
689 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.85 
 
 
681 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0087  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  75.73 
 
 
678 aa  1025    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  90.9 
 
 
683 aa  1312    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2383  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
583 aa  963    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
587 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.65 
 
 
696 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.31 
 
 
697 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2685  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.89 
 
 
583 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2742  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
583 aa  963    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  78.71 
 
 
583 aa  963    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  76.39 
 
 
608 aa  926    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  74.96 
 
 
591 aa  947    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.529352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.07 
 
 
638 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.72 
 
 
630 aa  620  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  53.8 
 
 
623 aa  617  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.09 
 
 
627 aa  608  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.34 
 
 
636 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.29 
 
 
603 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.28 
 
 
639 aa  300  6e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  29.59 
 
 
604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.29 
 
 
606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.29 
 
 
606 aa  239  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1315  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  29 
 
 
665 aa  229  9e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.89 
 
 
791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.27 
 
 
709 aa  201  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.04 
 
 
791 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.74 
 
 
791 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.17 
 
 
676 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.56 
 
 
794 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.69 
 
 
736 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.51 
 
 
768 aa  181  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.65 
 
 
670 aa  181  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.06 
 
 
731 aa  167  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.06 
 
 
656 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.23 
 
 
757 aa  167  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.25 
 
 
730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.97 
 
 
729 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  25.66 
 
 
795 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  26.01 
 
 
732 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0702  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.08 
 
 
769 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000299094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.23 
 
 
705 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.75 
 
 
704 aa  143  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.23 
 
 
705 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.78 
 
 
705 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  34.36 
 
 
1197 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.53 
 
 
788 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>