More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0008 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 634 aa  1251    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.68 
 
 		 635 aa  964    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  83.72 
 
 		 615 aa  948    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  54.88 
 
 		 643 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  54.72 
 
 		 643 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  54.56 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  48.91 
 
 		 645 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  47.32 
 
 		 591 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  41.82 
 
 		 659 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 623 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  41.38 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 683 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  39.33 
 
 		 666 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  39.01 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 668 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 627 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  38.29 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 638 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  40.73 
 
 		 627 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 631 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  41.17 
 
 		 677 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40.07 
 
 		 677 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40.07 
 
 		 677 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 672 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 634 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 634 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  40.45 
 
 		 670 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 627 aa  360  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  40.55 
 
 		 677 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  40.13 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  39.97 
 
 		 621 aa  357  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  39.71 
 
 		 668 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  38.27 
 
 		 669 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 672 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  38.67 
 
 		 669 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 677 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  41.05 
 
 		 665 aa  350  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  38.18 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 621 aa  344  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  38.93 
 
 		 604 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  38.95 
 
 		 630 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  37.48 
 
 		 604 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.19 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.9 
 
 		 621 aa  331  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  37.02 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  37.29 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  37.63 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  36.45 
 
 		 604 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  38.46 
 
 		 638 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  37.04 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.39 
 
 		 597 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.15 
 
 		 633 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  35.93 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.77 
 
 		 600 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  56.91 
 
 		 322 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 585 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.48 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 591 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  37.23 
 
 		 600 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 586 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 		 652 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.88 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  57.43 
 
 		 310 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 635 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 643 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 585 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  37.84 
 
 		 611 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 585 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 585 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 634 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 635 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  34.98 
 
 		 635 aa  296  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 634 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  35.66 
 
 		 585 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 618 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  29.62 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  36.41 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.97 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  34.07 
 
 		 667 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.4 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 603 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 603 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  32.23 
 
 		 603 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  29.43 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  35.91 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>