More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3408 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  70.95 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  69.71 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  72.08 
 
 		 252 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  69.71 
 
 		 244 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  70.54 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  70.12 
 
 		 243 aa  344  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  70.54 
 
 		 243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  71.25 
 
 		 251 aa  341  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  67.56 
 
 		 278 aa  337  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  68.46 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  69.71 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  68.62 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  71.25 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  71.25 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  68.64 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  68.64 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.49 
 
 		 244 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  61.67 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  64.94 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  60.16 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.92 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.92 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  60.83 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.66 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.08 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.67 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  61.25 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  60.8 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  59.51 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  61.25 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  59.92 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  58.33 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.37 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  61.13 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  62.86 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.35 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  61.04 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.33 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  57.5 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  58.09 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.58 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.67 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.16 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.75 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.89 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60.83 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  63.07 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  59.43 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  58.33 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.08 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  57.03 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  58.33 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.2 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  58.75 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.94 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>