213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3364 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3364  septum formation inhibitor  100 
 
 		 255 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  83.33 
 
 		 264 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  83.52 
 
 		 267 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  56.41 
 
 		 270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  56.41 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3033  septum formation inhibitor  56.41 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2113  septum formation inhibitor  55.68 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0799  septum formation inhibitor  55.68 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2631  septum formation inhibitor  55.68 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1981  septum formation inhibitor  55.68 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.52913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1569  septum formation inhibitor  55.93 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0035  septum formation inhibitor  52.48 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0064  septum formation inhibitor  55.76 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1054  septum formation inhibitor  51.76 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0655  septum formation inhibitor  52.65 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  53.99 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  54.37 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  54.37 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0855  septum formation inhibitor  55.08 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2416  septum formation inhibitor  55.64 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3425  septum formation inhibitor  54.26 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0843  septum formation inhibitor  55.12 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4087  septum formation inhibitor  54.41 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  44.35 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  44.35 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  46.53 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  43.97 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  43.85 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  42.51 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  44 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  40.23 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  45.24 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  64.22 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  38.34 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  62.04 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  35.6 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  39.11 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  39.69 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2302  septum site-determining protein MinC  41.77 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2036  septum site-determining protein MinC  40.4 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  35.98 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  35.91 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  38.22 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  36.8 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  36.88 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  37.4 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  33.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  33.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  33.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  33.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  33.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  36.65 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  37.86 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  36.33 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  35.46 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  34.15 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  34.69 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  36.49 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  37.5 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  37.67 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  36.14 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  38.06 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  32.53 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  32.27 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  30.89 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  30.89 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  30.89 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  30.89 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  30.89 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  31.87 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  35.37 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  31.17 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  36.61 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  30.68 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  33.78 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  32.68 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  35.46 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  36.22 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  36.36 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  31.02 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  34.14 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  29.44 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  33.06 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  35.91 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  34.96 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  33.33 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  31.97 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  29.03 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  33.05 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  34.15 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  50 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  50 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  29.03 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  29.03 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  50 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  50 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  29.37 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  33.47 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0711428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>