254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3356 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  100 
 
 
101 aa  209  8e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  87.13 
 
 
101 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  89.8 
 
 
99 aa  186  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  71.58 
 
 
125 aa  145  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  71.28 
 
 
119 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0095  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  64.21 
 
 
102 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2978  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  64.21 
 
 
125 aa  130  8e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  64.21 
 
 
102 aa  130  8e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0458718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.05 
 
 
102 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3338  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
137 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.96 
 
 
96 aa  124  4e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3258  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.05 
 
 
102 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1617  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2985  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0896385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3384  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
130 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0207  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
123 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4002  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.16 
 
 
102 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2926  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.33 
 
 
101 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0068  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.16 
 
 
102 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0010  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.61 
 
 
96 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0770  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.05 
 
 
95 aa  117  5e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1419  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  59.78 
 
 
97 aa  116  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1118  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60.67 
 
 
96 aa  116  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0057  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60 
 
 
93 aa  113  8e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51 
 
 
100 aa  113  1e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1825  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  57.61 
 
 
122 aa  113  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.309531  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.57 
 
 
101 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1388  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  52.53 
 
 
104 aa  110  4e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4648  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.76 
 
 
96 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51 
 
 
101 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.19 
 
 
101 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0094  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.65 
 
 
96 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.41 
 
 
101 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3728  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.02 
 
 
101 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0248  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.68 
 
 
99 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50.51 
 
 
101 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.48 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  51.72 
 
 
91 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4174  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  55.56 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.25 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  55.26 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2474  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.45 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791787  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  55.13 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
NC_004310  BR0082  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.66 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.406903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0080  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.66 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.24 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.94 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.31 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
103 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  48.86 
 
 
94 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.72 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.25 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54.55 
 
 
92 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  55.84 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.35 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.83 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.55 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1689  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.73 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.39 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0673  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.24 
 
 
96 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252201  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.82 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01754  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase protein  55.22 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.9371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04911  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  42.39 
 
 
96 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.449188  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.74 
 
 
97 aa  83.2  1e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.32 
 
 
96 aa  83.2  1e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.32 
 
 
96 aa  83.2  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1824  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.78 
 
 
101 aa  83.2  1e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.749262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  53.85 
 
 
83 aa  82.8  2e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  39.78 
 
 
101 aa  82  3e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.11 
 
 
97 aa  81.6  4e-15  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.05 
 
 
97 aa  80.9  6e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0706  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.95 
 
 
102 aa  80.9  6e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14356  predicted protein  56.67 
 
 
64 aa  80.1  1e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.05 
 
 
97 aa  79  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0380  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.59 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0376  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.04 
 
 
103 aa  75.1  3e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1692  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.25 
 
 
109 aa  74.7  4e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.56 
 
 
91 aa  74.7  4e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2232  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54.05 
 
 
77 aa  73.6  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1008  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.48 
 
 
76 aa  72.4  2e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.56 
 
 
97 aa  71.2  5e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.11 
 
 
97 aa  70.5  7e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.22 
 
 
94 aa  68.9  2e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.75 
 
 
103 aa  69.3  2e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0994809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.78 
 
 
93 aa  69.3  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0475  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.14 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.86 
 
 
105 aa  68.2  4e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 
93 aa  67.4  6e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  2.04873e-14  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.5 
 
 
94 aa  67.4  7e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.78 
 
 
102 aa  66.6  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1768  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.82 
 
 
93 aa  66.6  1e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.63 
 
 
93 aa  66.6  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.67 
 
 
103 aa  65.5  3e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.5 
 
 
120 aa  64.3  5e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.5 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.3 
 
 
117 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.71 
 
 
94 aa  62.8  2e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  2.24149e-10  normal  0.214474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>