More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3346 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  82.35 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  83.04 
 
 		 289 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  64.49 
 
 		 302 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  61.31 
 
 		 313 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  45.79 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  41.24 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  43.91 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  41.49 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  41.13 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  41.13 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  41.13 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  41.13 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  40.86 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  40.86 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  39.01 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 320 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  35.79 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  32.03 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  39.34 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  31.64 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 559 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  34.69 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  34.69 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  36.03 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  34.69 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  36.82 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  35.55 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  32.03 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.5 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  31.4 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  34.2 
 
 		 585 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  28.46 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 594 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  29.34 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  29.34 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  29.89 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  29.32 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.82 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  29.34 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  29.34 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  29.34 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  29.32 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  30.07 
 
 		 586 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  28.74 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  29 
 
 		 585 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  29 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  29 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  30.04 
 
 		 580 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  29 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  34.89 
 
 		 586 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  27.68 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  29.13 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 590 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  34.47 
 
 		 586 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  27.61 
 
 		 587 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  27.61 
 
 		 587 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  28.25 
 
 		 585 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 587 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  27.88 
 
 		 585 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 594 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>