More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3309 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  72.77 
 
 		 209 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  72.28 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  64.36 
 
 		 206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  60.1 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.74 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  49.02 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  45.77 
 
 		 204 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  46.8 
 
 		 202 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  48.76 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  47.78 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.8 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  46.31 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  44.33 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  45.77 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  43.35 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  45.32 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  46.15 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  44.28 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  44.28 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  44.28 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.77 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  44.55 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  43.84 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  42.79 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  45.77 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  45.77 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  41.79 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.28 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2419  putative glutathione S-transferase  55.56 
 
 		 147 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0597  glutathione S-transferase, putative  55.56 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2779  putative glutathione S-transferase  55.56 
 
 		 147 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2840  glutathione S-transferase  55.56 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1730  putative glutathione S-transferase  55.56 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2872  putative glutathione S-transferase  55.56 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  41.29 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  42.79 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  42.93 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2721  putative glutathione S-transferase  53.47 
 
 		 147 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  41.29 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  42.79 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.11 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  42.42 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  42.29 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  40.3 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.43 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  41.67 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.06 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  37.31 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  40.8 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  41.38 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  40.51 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  39.61 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  39 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  38.86 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  41.09 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  42.23 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  41.09 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.35 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  38.46 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.5 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  41.87 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  36.54 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  39.22 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.6 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  37.09 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  37.8 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  38.28 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 		 299 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  35.41 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  31.28 
 
 		 217 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  35.62 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  33.98 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  36.32 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  31.96 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>