108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3286 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  64.65 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  64.65 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  67.2 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  67.2 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  67.2 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  64.65 
 
 		 202 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  67.2 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  67.2 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  67.2 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  67.2 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  65.13 
 
 		 202 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  67.2 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  66.67 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  66.15 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  65.62 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  50.52 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  49.48 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  50.27 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  50.27 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  47.74 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  46.73 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  46.73 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  46.73 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  48.88 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  46.2 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  39.47 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  38.3 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  39.11 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  43.6 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  39.89 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  42.16 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  43.01 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  43.01 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  43.01 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  43.24 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  40.59 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  43.24 
 
 		 289 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  43.24 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  41.76 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  34.62 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  35.03 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  34.34 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  32.57 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  31.98 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  35.71 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  35.12 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  32.95 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  34.52 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  32.45 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  35.29 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  35.29 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  33.93 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  32.72 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  30.43 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  30.67 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  30.62 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  32.77 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  31.25 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  41.67 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  41.67 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  35.09 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  31.71 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  35.26 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  29.21 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  32.16 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  36.65 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  35.79 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  29.94 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  29.94 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  32.35 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  28.4 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  31.2 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  29.63 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  30.77 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  29.89 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  25.3 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  28.03 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  32.12 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  42.11 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  29.35 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  36.27 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  29.41 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  31.76 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  31.76 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  29.38 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5027  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  40.54 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42279  normal  0.634869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  28 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  29.01 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  26.5 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1716  N-acylhomoserine lactone synthase YpsI  25.32 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105822  hitchhiker  0.000229344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4148  Acyl-homoserine-lactone synthase  25 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>