23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3213 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  65.9 
 
 		 164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  60.1 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  55.96 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  67.23 
 
 		 115 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  32.6 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  99.8  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  98.2  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  97.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_003296  RS03902  hypothetical protein  88.24 
 
 		 56 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3126  hypothetical protein  68 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.095308  decreased coverage  0.00800037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  28.7 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  50.7 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  44.05 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  48.39 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  49.25 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  53.62 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  52.94 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  48.72 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  32.57 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>