123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3188 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 2751 aa  5336    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  80.48 
 
 		 2691 aa  2868    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  52.33 
 
 		 2737 aa  1013    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  36.62 
 
 		 2536 aa  952    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  31.7 
 
 		 3929 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  67.86 
 
 		 2786 aa  2972    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.68 
 
 		 2847 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.85 
 
 		 2666 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0157  adhesin HecA  32.02 
 
 		 2204 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  37.41 
 
 		 1035 aa  394  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.67 
 
 		 2818 aa  365  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.98 
 
 		 2827 aa  190  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  35.7 
 
 		 761 aa  184  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.07 
 
 		 3141 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.62 
 
 		 3967 aa  168  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  28.85 
 
 		 3131 aa  164  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  29.16 
 
 		 3144 aa  162  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  29.11 
 
 		 3322 aa  160  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 		 2545 aa  159  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  35.58 
 
 		 6274 aa  159  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  30.03 
 
 		 2588 aa  159  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.95 
 
 		 3602 aa  158  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  30.03 
 
 		 2530 aa  158  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.48 
 
 		 3128 aa  158  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  26.97 
 
 		 3350 aa  156  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.5 
 
 		 3147 aa  155  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.81 
 
 		 2345 aa  153  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.41 
 
 		 2421 aa  152  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  33.24 
 
 		 2758 aa  151  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  31.24 
 
 		 1489 aa  150  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  27.26 
 
 		 3443 aa  150  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  28.16 
 
 		 3563 aa  150  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.56 
 
 		 3159 aa  149  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  30.71 
 
 		 3004 aa  148  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  29.95 
 
 		 5212 aa  148  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.95 
 
 		 3796 aa  147  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  37.81 
 
 		 594 aa  145  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.68 
 
 		 2600 aa  145  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.92 
 
 		 3862 aa  144  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.86 
 
 		 658 aa  142  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.4 
 
 		 2670 aa  140  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.23 
 
 		 3301 aa  137  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  31.35 
 
 		 3141 aa  137  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  31.42 
 
 		 3141 aa  136  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.38 
 
 		 3501 aa  135  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.2 
 
 		 3790 aa  134  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.56 
 
 		 3040 aa  133  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.42 
 
 		 5981 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02096  hypothetical protein  93.75 
 
 		 75 aa  131  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0983188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.65 
 
 		 3552 aa  130  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.15 
 
 		 1730 aa  130  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  27.53 
 
 		 3081 aa  130  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  41.86 
 
 		 306 aa  128  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.92 
 
 		 1723 aa  127  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.9 
 
 		 3884 aa  126  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.51 
 
 		 3079 aa  125  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  28.96 
 
 		 1998 aa  125  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.54 
 
 		 3785 aa  124  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.45 
 
 		 3020 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.97 
 
 		 2782 aa  123  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.67 
 
 		 4966 aa  122  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.62 
 
 		 812 aa  122  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  26.77 
 
 		 1651 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 		 3475 aa  121  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 		 3480 aa  118  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 		 3378 aa  118  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  33.33 
 
 		 1270 aa  118  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.03 
 
 		 2984 aa  116  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  31.12 
 
 		 3526 aa  116  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  29.63 
 
 		 2449 aa  116  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  31.56 
 
 		 3165 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.77 
 
 		 1508 aa  114  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.86 
 
 		 1508 aa  112  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.97 
 
 		 1508 aa  111  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  45.04 
 
 		 2061 aa  111  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  24.87 
 
 		 1745 aa  110  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.48 
 
 		 678 aa  108  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  23.95 
 
 		 1635 aa  107  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.19 
 
 		 721 aa  106  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.26 
 
 		 678 aa  103  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.9 
 
 		 923 aa  103  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.54 
 
 		 1508 aa  102  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  23.17 
 
 		 1618 aa  99.8  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.83 
 
 		 1615 aa  99  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  29.5 
 
 		 846 aa  93.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  25.86 
 
 		 914 aa  91.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  30.44 
 
 		 846 aa  90.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  25.95 
 
 		 905 aa  90.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  25.95 
 
 		 905 aa  90.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  25.95 
 
 		 898 aa  90.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  25.86 
 
 		 901 aa  90.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  26.24 
 
 		 893 aa  89.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  25.95 
 
 		 911 aa  89.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.24 
 
 		 681 aa  88.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  23.38 
 
 		 2964 aa  87.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  23.55 
 
 		 2542 aa  87.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  23.4 
 
 		 2651 aa  87  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  29.9 
 
 		 716 aa  86.7  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  25.59 
 
 		 1719 aa  84.7  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  28.01 
 
 		 1841 aa  83.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>