147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3162 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 1012 aa  1924    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  46.68 
 
 		 939 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  40.49 
 
 		 972 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.27 
 
 		 774 aa  485  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 		 2848 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  31.43 
 
 		 1025 aa  127  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  36.05 
 
 		 3484 aa  121  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  28.74 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  29.21 
 
 		 1369 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 10429 aa  101  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 		 2346 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 		 2365 aa  96.3  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  29.35 
 
 		 1508 aa  96.3  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  30.03 
 
 		 2396 aa  95.5  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  28.53 
 
 		 2371 aa  95.1  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  29.72 
 
 		 2366 aa  95.1  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  33.81 
 
 		 1001 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 		 1782 aa  93.2  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 		 994 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.84 
 
 		 1242 aa  89.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  31.62 
 
 		 991 aa  89  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  31.56 
 
 		 1001 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  28.22 
 
 		 3954 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 4238 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 4238 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 3822 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  29.5 
 
 		 985 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.77 
 
 		 1028 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.58 
 
 		 1227 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.34 
 
 		 983 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.71 
 
 		 763 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.27 
 
 		 1011 aa  77.8  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  29.35 
 
 		 664 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 1033 aa  75.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 1004 aa  75.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.43 
 
 		 1769 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 		 980 aa  74.7  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.92 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.42 
 
 		 1459 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.46 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.34 
 
 		 1081 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  27.08 
 
 		 1130 aa  72  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.63 
 
 		 2003 aa  71.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  27.57 
 
 		 2407 aa  71.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 1886 aa  71.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 1458 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.08 
 
 		 1256 aa  70.5  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  23.89 
 
 		 677 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  30.82 
 
 		 1177 aa  70.1  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.12 
 
 		 1134 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.89 
 
 		 1673 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.3 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.42 
 
 		 1333 aa  68.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.76 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.82 
 
 		 972 aa  68.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  23.57 
 
 		 3506 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  26.56 
 
 		 1550 aa  68.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  25.45 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  25.61 
 
 		 1111 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.41 
 
 		 919 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 		 1164 aa  67.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  26.56 
 
 		 986 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.37 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.29 
 
 		 1285 aa  65.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.57 
 
 		 1489 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.17 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.34 
 
 		 1119 aa  65.1  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  29.23 
 
 		 1129 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0096  autotransporter beta-domain-containing protein  30.89 
 
 		 1035 aa  64.7  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  28.3 
 
 		 1672 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  29.23 
 
 		 1129 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  25.7 
 
 		 636 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  29.23 
 
 		 1131 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  29.23 
 
 		 1131 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  29.23 
 
 		 1131 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  29.23 
 
 		 1131 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.16 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  29.23 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  29.69 
 
 		 1016 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  22.89 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  27.52 
 
 		 1130 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  33.12 
 
 		 1179 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  23.67 
 
 		 990 aa  62.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  26.59 
 
 		 684 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  23.86 
 
 		 1222 aa  61.6  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  28.48 
 
 		 1038 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.54 
 
 		 1322 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  27.19 
 
 		 1154 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  24.47 
 
 		 646 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 1180 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  32.7 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  24.81 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  24.3 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.73 
 
 		 1848 aa  59.3  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.22 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  23.13 
 
 		 1056 aa  58.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  25.48 
 
 		 1519 aa  58.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  27.64 
 
 		 1677 aa  57.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>