More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2981 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 		 331 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.43 
 
 		 331 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.52 
 
 		 331 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  78.27 
 
 		 336 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.34 
 
 		 334 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.48 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.48 
 
 		 331 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.39 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.39 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.39 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.39 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.39 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.34 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.18 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.88 
 
 		 331 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.88 
 
 		 331 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.68 
 
 		 331 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.17 
 
 		 331 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.17 
 
 		 331 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.17 
 
 		 331 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.25 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.86 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.94 
 
 		 344 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.04 
 
 		 335 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.04 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.64 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.16 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.7 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.8 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.98 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.87 
 
 		 332 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.22 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.6 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.01 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.58 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.18 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.26 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.26 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.38 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.6 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.6 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.31 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.13 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.44 
 
 		 313 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.05 
 
 		 337 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.01 
 
 		 331 aa  358  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.04 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.79 
 
 		 319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.77 
 
 		 332 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.05 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.77 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.73 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.34 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0621  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.69 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  54.85 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.89 
 
 		 301 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.05 
 
 		 341 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.35 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.35 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.48 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.06 
 
 		 317 aa  349  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.28 
 
 		 322 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.48 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.05 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.9 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.48 
 
 		 344 aa  348  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.65 
 
 		 316 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.76 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.19 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.6 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.07 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.11 
 
 		 298 aa  345  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.46 
 
 		 302 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.89 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.76 
 
 		 315 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.04 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.02 
 
 		 336 aa  341  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.06 
 
 		 315 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.29 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.69 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.47 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.29 
 
 		 301 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.24 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 		 300 aa  339  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.39 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.01 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.62 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.17 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.66 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.85 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.46 
 
 		 334 aa  332  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.46 
 
 		 334 aa  331  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.46 
 
 		 334 aa  331  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>