More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2920 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  100 
 
 		 801 aa  1627    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  54.02 
 
 		 741 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  51.73 
 
 		 734 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  51.88 
 
 		 753 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  53.8 
 
 		 737 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  53.95 
 
 		 753 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  53.18 
 
 		 745 aa  747    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  49.63 
 
 		 729 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  51.73 
 
 		 750 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  53.77 
 
 		 738 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 		 729 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  51.52 
 
 		 754 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  51.37 
 
 		 754 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  52.77 
 
 		 806 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  53.95 
 
 		 753 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  51.59 
 
 		 750 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  54.02 
 
 		 752 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  51.52 
 
 		 754 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  54.02 
 
 		 736 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  54.02 
 
 		 736 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  49.33 
 
 		 725 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  48.86 
 
 		 729 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  49.33 
 
 		 725 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  48.4 
 
 		 729 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  48.06 
 
 		 725 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.8 
 
 		 833 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 		 829 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  41.41 
 
 		 799 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  40.33 
 
 		 821 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  44.03 
 
 		 723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  40.18 
 
 		 819 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 		 778 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  38.64 
 
 		 808 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  38.79 
 
 		 808 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  42.84 
 
 		 769 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 829 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 828 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  39.82 
 
 		 831 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  41.76 
 
 		 733 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  41.51 
 
 		 729 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.83 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 815 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 		 810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 789 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 794 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 820 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  38.25 
 
 		 802 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  38.15 
 
 		 810 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 817 aa  469  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 810 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  39.29 
 
 		 791 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  40.9 
 
 		 748 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 812 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  41.15 
 
 		 745 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  38.85 
 
 		 791 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 		 828 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.21 
 
 		 806 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  39.97 
 
 		 729 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.03 
 
 		 797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  40.72 
 
 		 701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  38.94 
 
 		 747 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 828 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  39.1 
 
 		 754 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 		 719 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 		 828 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  39.08 
 
 		 747 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 797 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 747 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 717 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  41.76 
 
 		 717 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 863 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 745 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  38.66 
 
 		 747 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  39.56 
 
 		 750 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  36.94 
 
 		 799 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 		 740 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  37.55 
 
 		 747 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  37.69 
 
 		 747 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  39.07 
 
 		 703 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  39.07 
 
 		 729 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  39.07 
 
 		 703 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 771 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  37.65 
 
 		 745 aa  435  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 		 771 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  38.52 
 
 		 729 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  37.55 
 
 		 747 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 735 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  38.39 
 
 		 729 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.4 
 
 		 717 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 744 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  37.23 
 
 		 752 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 744 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  37.42 
 
 		 747 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  37.42 
 
 		 747 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  38.96 
 
 		 728 aa  422  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 		 714 aa  416  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 		 728 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 728 aa  416  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>