174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2908 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 504 aa  1026    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  65.34 
 
 		 533 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  64.8 
 
 		 588 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  94.43 
 
 		 530 aa  956    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  94.23 
 
 		 520 aa  953    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  57.17 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  54.76 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  54.56 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 511 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  54.96 
 
 		 505 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  52.99 
 
 		 517 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  52.19 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 517 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  53.69 
 
 		 533 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 517 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 517 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  53.39 
 
 		 517 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  53.19 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  52.99 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  52.99 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  52.69 
 
 		 522 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  51.59 
 
 		 522 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  52.19 
 
 		 522 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  54.08 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  53.2 
 
 		 559 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  52.8 
 
 		 642 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  52.8 
 
 		 604 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  51.43 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  51.95 
 
 		 522 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  52.46 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  52.37 
 
 		 559 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  51.97 
 
 		 641 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  51.99 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  50.5 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  51.32 
 
 		 522 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  50.79 
 
 		 541 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  51.31 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  45.16 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  50.1 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  46.76 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  48.67 
 
 		 519 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  46.99 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  45.9 
 
 		 503 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  45.93 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  45.25 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  45.4 
 
 		 525 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  43.6 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  45.51 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  44.19 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  44.61 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  44.81 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  41.63 
 
 		 529 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  41.98 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  42.18 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  43.18 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  41.75 
 
 		 604 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  42.18 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  41.97 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  43.24 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  42.74 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  42.18 
 
 		 608 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  43.18 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  42.18 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  41.55 
 
 		 604 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  41.16 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  41.75 
 
 		 558 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  43.18 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  42.65 
 
 		 544 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  43.24 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  43.18 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  42.32 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  42 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  43.72 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  42 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  42.2 
 
 		 545 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  42 
 
 		 545 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  43.06 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  44.04 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  42.09 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  44.31 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  41.87 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  43.91 
 
 		 545 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  41.96 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  41.43 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  43.63 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  43.74 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  43.42 
 
 		 539 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  44.01 
 
 		 527 aa  362  6e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  41.67 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  43.34 
 
 		 540 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  42.86 
 
 		 534 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  40.89 
 
 		 587 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  41.53 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>