146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2876 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  100 
 
 		 380 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  88.02 
 
 		 384 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  87.89 
 
 		 380 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  67.31 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  65.24 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  58.54 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  58.31 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  58.47 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 382 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  60.68 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.68 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  61.61 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  60.68 
 
 		 410 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  58.14 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  60.68 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  60.68 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  58.2 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  60.68 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  60.68 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  51.24 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  55.97 
 
 		 376 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  48.24 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  43.85 
 
 		 405 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  45.45 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  45.03 
 
 		 400 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  44.59 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  47.62 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.83 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  41.84 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.56 
 
 		 385 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  40.16 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  40.16 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  40.58 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  41.34 
 
 		 433 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  39.89 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  41.57 
 
 		 431 aa  238  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  38.86 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  44.95 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  39.72 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  44.98 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  44.48 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  38.83 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  41.73 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  42.11 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  42.62 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  39.89 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  43.21 
 
 		 456 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  38.4 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  41.38 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  39.64 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  38.95 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  37.47 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0640  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  56.25 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699933  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  32.54 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  34.91 
 
 		 542 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  40.13 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  39.81 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  37.74 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  33.06 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  33.06 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.97 
 
 		 502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  31.61 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  34.51 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.43 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 506 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  35.07 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  39.59 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  37.37 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  66.17 
 
 		 134 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  32.6 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  32.6 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  31.98 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  37.33 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  37.96 
 
 		 514 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  34.31 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  36.57 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  32.87 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  33.15 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  33.91 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.41 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.24 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  37.63 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  34.15 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  34.15 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  36.64 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  38.15 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  30.34 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  39.84 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  39.1 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  31.78 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0967  MltA  33.8 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.820227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  30.02 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.84 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  33.04 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>