31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2858 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  100 
 
 
384 aa  777  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  85.4 
 
 
365 aa  634  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  88.37 
 
 
365 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  62.16 
 
 
379 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  64.97 
 
 
385 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  56.86 
 
 
363 aa  352  6e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  54.87 
 
 
357 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  51.78 
 
 
369 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  52.45 
 
 
399 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  50.59 
 
 
374 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  48.75 
 
 
360 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  49.58 
 
 
381 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  45.89 
 
 
376 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  49.58 
 
 
381 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  46.36 
 
 
363 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  46.78 
 
 
387 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  47.62 
 
 
357 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.75774e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  48.05 
 
 
353 aa  285  1e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  46.55 
 
 
363 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  48.77 
 
 
336 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  48.77 
 
 
375 aa  274  2e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  42.64 
 
 
442 aa  272  8e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  44.31 
 
 
351 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  47.66 
 
 
384 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  43.98 
 
 
351 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  44.13 
 
 
385 aa  258  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  44.67 
 
 
355 aa  254  1e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  37.5 
 
 
356 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  31.91 
 
 
349 aa  116  8e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  26.41 
 
 
340 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  28.44 
 
 
343 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  7.16532e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>