181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2838 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  86.14 
 
 		 166 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  85.54 
 
 		 166 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.67 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.27 
 
 		 168 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  66.87 
 
 		 167 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  64.46 
 
 		 166 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  64.46 
 
 		 166 aa  237  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  66.27 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  66.87 
 
 		 167 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.66 
 
 		 168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  65.66 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  65.06 
 
 		 168 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 168 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 168 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  65.66 
 
 		 168 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  62.42 
 
 		 169 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 168 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  64.24 
 
 		 168 aa  230  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 214 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  65.66 
 
 		 214 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.06 
 
 		 168 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.06 
 
 		 168 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  65.06 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.42 
 
 		 183 aa  224  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  63.8 
 
 		 168 aa  224  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  63.25 
 
 		 185 aa  223  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  62.05 
 
 		 167 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.82 
 
 		 168 aa  220  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  59.39 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  61.21 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  58.43 
 
 		 168 aa  214  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  60.61 
 
 		 168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  58.79 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  59.39 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  55.42 
 
 		 168 aa  197  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  59.04 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  56.63 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  56.63 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  59.86 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.52 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  56.43 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  54.29 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  55.42 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  52.12 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  49.4 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  54.82 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  54.82 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  54.82 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.01 
 
 		 157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  51.2 
 
 		 161 aa  163  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  52.41 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  51.2 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  46.99 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  52.41 
 
 		 178 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  50 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  53.01 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  53.01 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  47.59 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  52.41 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  49.4 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  52.41 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.4 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  48.19 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  48.8 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  48.8 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.27 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  48.19 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  46.06 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.8 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  47.59 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  46.99 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  49.62 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.27 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  45.18 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  44.58 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  42.17 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.24 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  44.58 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  43.37 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  44.58 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  42.11 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  44.94 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02641  peroxiredoxin  47.86 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  41.57 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  44.58 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  39.89 
 
 		 233 aa  134  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  45.39 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  43.29 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>