More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2713 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2713  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 383 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 397 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.68 
 
 		 376 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 397 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 397 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 397 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 394 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  82.98 
 
 		 376 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.05 
 
 		 397 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2547  queuine tRNA-ribosyltransferase  93.21 
 
 		 383 aa  725    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0677193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  92.95 
 
 		 383 aa  725    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.74 
 
 		 472 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.79 
 
 		 397 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.22 
 
 		 395 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.22 
 
 		 395 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.95 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.16 
 
 		 447 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.95 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.17 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.69 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.43 
 
 		 404 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.43 
 
 		 400 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.9 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.89 
 
 		 370 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.32 
 
 		 369 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.74 
 
 		 390 aa  534  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.75 
 
 		 375 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.99 
 
 		 390 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0596  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.16 
 
 		 390 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.99 
 
 		 390 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.95 
 
 		 367 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.76 
 
 		 370 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.96 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1567  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.49 
 
 		 390 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.81 
 
 		 399 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.48 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0626  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.02 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.46 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.96 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.17 
 
 		 377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.49 
 
 		 377 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.17 
 
 		 374 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.17 
 
 		 374 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.17 
 
 		 374 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.19 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.25 
 
 		 385 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.12 
 
 		 377 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.91 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.64 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.12 
 
 		 374 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.38 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.68 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.61 
 
 		 374 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.95 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.61 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.43 
 
 		 385 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.34 
 
 		 381 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.53 
 
 		 378 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.27 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  62.8 
 
 		 382 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.4 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.59 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.08 
 
 		 381 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.59 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.59 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.23 
 
 		 381 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.59 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.06 
 
 		 374 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.9 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.4 
 
 		 374 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.32 
 
 		 375 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.81 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.42 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.43 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.96 
 
 		 375 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.86 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.96 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.9 
 
 		 371 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.79 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.76 
 
 		 371 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.9 
 
 		 377 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.7 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>