More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2565 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  100 
 
 
177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  82.42 
 
 
176 aa  284  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  82.42 
 
 
176 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2910  GCN5-related N-acetyltransferase  70.81 
 
 
163 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  65.45 
 
 
169 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  60.13 
 
 
165 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  58.97 
 
 
162 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  58.97 
 
 
162 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  60.65 
 
 
164 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  61.49 
 
 
162 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  55.21 
 
 
163 aa  190  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  61.04 
 
 
161 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  61.04 
 
 
161 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  61.04 
 
 
161 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  60.39 
 
 
161 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4218  GCN5-related N-acetyltransferase  60.78 
 
 
161 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  59.74 
 
 
161 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0429  GCN5-related N-acetyltransferase  58.6 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  59.35 
 
 
161 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.069585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1702  acetyltransferase  56.86 
 
 
160 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0061142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  54.14 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  51.83 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1057  putative acetyltransferase  58.06 
 
 
174 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281003  normal  0.387575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0515  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2923  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00907256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2496  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0177281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1819  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2868  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2786  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.113285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2807  acetyltransferase  57.53 
 
 
167 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  53.21 
 
 
160 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  57.33 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  55.48 
 
 
162 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.782337  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  46.41 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  55.48 
 
 
169 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  47.77 
 
 
161 aa  158  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  51.95 
 
 
168 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6099  putative acetyltransferase family protein  49.36 
 
 
161 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  48.72 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 
157 aa  154  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  52.29 
 
 
163 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
168 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
159 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
170 aa  151  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 
156 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  48.72 
 
 
160 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  48.05 
 
 
159 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
159 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  48.75 
 
 
163 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
159 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  51.59 
 
 
173 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  46.15 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  45.86 
 
 
160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7546  putative acetyltransferase protein  49.69 
 
 
160 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
165 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  45.51 
 
 
159 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
171 aa  141  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  47.18 
 
 
160 aa  141  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
165 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
163 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 
159 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
165 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  43.59 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1728  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000677629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  41.4 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  48.99 
 
 
165 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1814  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
166 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000670024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  48.99 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  48.99 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0709  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
159 aa  137  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
159 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  43.59 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  52.21 
 
 
165 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  46.15 
 
 
163 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2073  GCN5-related N-acetyltransferase  49.01 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  47.4 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4180  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 
163 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  48.7 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  42.95 
 
 
158 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  43.59 
 
 
158 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  42.95 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3690  GCN5-related N-acetyltransferase  49.67 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0600  argininosuccinate synthase (citrulline--aspartateligase)  36.71 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  40.26 
 
 
156 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
164 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.669908  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0086  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
165 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3753  GCN5-related N-acetyltransferase  39.64 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04470  acetyltransferase (GNAT) family protein  37.91 
 
 
158 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0776164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>