More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2563 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  64.49 
 
 
681 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  65.8 
 
 
662 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  64.98 
 
 
667 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
636 aa  1283    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  63.77 
 
 
687 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  64.05 
 
 
684 aa  813    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  64.05 
 
 
684 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  74.07 
 
 
652 aa  955    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  64.05 
 
 
684 aa  813    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  64.52 
 
 
681 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  64.82 
 
 
661 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  65.81 
 
 
705 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  64.05 
 
 
684 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  92.16 
 
 
647 aa  1172    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  64.42 
 
 
688 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  91.22 
 
 
635 aa  1162    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  64.98 
 
 
661 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  75.78 
 
 
655 aa  958    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  65.24 
 
 
667 aa  821    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  64.99 
 
 
691 aa  809    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  64.05 
 
 
684 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  65.14 
 
 
661 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  65.24 
 
 
667 aa  821    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  54.87 
 
 
622 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  53.22 
 
 
644 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  52.59 
 
 
613 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  54.05 
 
 
657 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  53.89 
 
 
657 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  52.04 
 
 
616 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  51.79 
 
 
660 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  53.65 
 
 
651 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  53.27 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  51.14 
 
 
698 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  51.75 
 
 
615 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  50.74 
 
 
664 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  51.79 
 
 
625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  52.7 
 
 
604 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  52.36 
 
 
628 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  51.64 
 
 
623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  50.46 
 
 
632 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  50 
 
 
633 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  50.31 
 
 
645 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  50.7 
 
 
632 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  50.63 
 
 
633 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  50.7 
 
 
633 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  51.47 
 
 
641 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  49.85 
 
 
633 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  50.46 
 
 
611 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  49.61 
 
 
648 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  46.91 
 
 
641 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  49.37 
 
 
635 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.13 
 
 
629 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  45.82 
 
 
630 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  48.75 
 
 
621 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  49.53 
 
 
619 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 
611 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  47.21 
 
 
644 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  46.83 
 
 
636 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  49.29 
 
 
626 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  42.79 
 
 
630 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  47.11 
 
 
617 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  45.33 
 
 
620 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  42.18 
 
 
575 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.65 
 
 
632 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  43.14 
 
 
632 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 
612 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  41.54 
 
 
602 aa  425  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  43.27 
 
 
616 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  42.58 
 
 
595 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.71 
 
 
643 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.85 
 
 
603 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  42.58 
 
 
595 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  39.43 
 
 
600 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 
644 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.46 
 
 
633 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  41.86 
 
 
606 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  39.59 
 
 
600 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  42.77 
 
 
629 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  40.8 
 
 
626 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  40.75 
 
 
617 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 
611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 
603 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  39.5 
 
 
603 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  40.63 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  40.83 
 
 
643 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 
603 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  42.46 
 
 
621 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  40.19 
 
 
597 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  61.68 
 
 
687 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.22 
 
 
606 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39 
 
 
595 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  40.57 
 
 
605 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  40.7 
 
 
661 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 
610 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  40.44 
 
 
599 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  40.6 
 
 
687 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  38 
 
 
647 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 
622 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 
623 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  41.3 
 
 
621 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>