174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2524 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  90.34 
 
 		 239 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  66.81 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  66.81 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  66.81 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  66.67 
 
 		 241 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  66.67 
 
 		 241 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  67.23 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  66.67 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  46.26 
 
 		 313 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  40 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  41.59 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  36.32 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  34.07 
 
 		 365 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  33.63 
 
 		 365 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  33.33 
 
 		 365 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  36.11 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  31.88 
 
 		 365 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  32.46 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  35 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  39.64 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  40.14 
 
 		 337 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  39.17 
 
 		 484 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  37.09 
 
 		 485 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  37.09 
 
 		 489 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  36.42 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  31.43 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  38.39 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  33.11 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.29 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.92 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30 
 
 		 373 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  31.75 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.03 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  35.17 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  36.43 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  30.41 
 
 		 364 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.01 
 
 		 375 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  32.82 
 
 		 378 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  30 
 
 		 550 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  32.89 
 
 		 378 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  33.33 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  26.56 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.93 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.89 
 
 		 366 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 384 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  36 
 
 		 422 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 343 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  31.45 
 
 		 397 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  32.26 
 
 		 389 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  34.68 
 
 		 364 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30.77 
 
 		 368 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  32.73 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  31.86 
 
 		 400 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  31.61 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  26.95 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  32.03 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  34.67 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  33.85 
 
 		 412 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  28.46 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  30.97 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  30.97 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  36.79 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  30.97 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  36.92 
 
 		 378 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  33.64 
 
 		 370 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  22.58 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  31.61 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.38 
 
 		 366 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 378 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  30.77 
 
 		 374 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  31.54 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  36.25 
 
 		 397 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  36.15 
 
 		 379 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  31.25 
 
 		 390 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  33.33 
 
 		 361 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  34.41 
 
 		 399 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.86 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  36.08 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  33.64 
 
 		 380 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33078  predicted protein  30.77 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.638325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  36.08 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  29.37 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  24.32 
 
 		 684 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  36.08 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  31.09 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  33.64 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  31.86 
 
 		 380 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  28.57 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.08 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  28.57 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  30.72 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  34.58 
 
 		 383 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  31.25 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>