243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2396 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  100 
 
 		 258 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  76.26 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  76.26 
 
 		 256 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  58.37 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  57.77 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  54.86 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  58.59 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  56.42 
 
 		 258 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  58.73 
 
 		 249 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  59.14 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  59.52 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  59.52 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  58.2 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  57.81 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  56.3 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  47.76 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  55.6 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.1 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  55.42 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  46.91 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  46.91 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  46.91 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  40.49 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  45.71 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  42.8 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.19 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.08 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.69 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  46.43 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.07 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.32 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  46.69 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.31 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  45.68 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  45.68 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  45.68 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  45.68 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.78 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  41.7 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.53 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.44 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.59 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  42.48 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  40.32 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  44.31 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.29 
 
 		 282 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.09 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.26 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.98 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.72 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.73 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.08 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.45 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.2 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.54 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.09 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.15 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.65 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.86 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.46 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.42 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.05 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.1 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.17 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  34.87 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.67 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.9 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.12 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.46 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.63 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.63 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.51 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.63 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.52 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.22 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.18 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  35.34 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.41 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.26 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.83 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.84 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.61 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>