53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2362 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  82.43 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  82.43 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  47.3 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  50.63 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  41.47 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  38.24 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  35.91 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  34.24 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  38.84 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  32.02 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  32.46 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  31.47 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  32.77 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  33.05 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  30.47 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  30.84 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  30.29 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  30.29 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  29.69 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  28.88 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  34.63 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  27.66 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  30.45 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0636  putative transmembrane protein  32.5 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  29.22 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  28.33 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  27.85 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  31.2 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  29.66 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  26.94 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  29.91 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  25.32 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  36.75 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  29.39 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  30.97 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  30.45 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  34.78 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  27.95 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  28.69 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  30.88 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  34.78 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  26.11 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  31.06 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  28.82 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  25.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  26.64 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  35.17 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  26.84 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>