More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2323 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  100 
 
 		 521 aa  1030    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  65.38 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  65.2 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  65.07 
 
 		 574 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  65.2 
 
 		 512 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  64.44 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  64.65 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  64.65 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  64.65 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  63.24 
 
 		 543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  63.47 
 
 		 515 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  63.96 
 
 		 529 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  59.02 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.97 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 480 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 522 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.94 
 
 		 469 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 510 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  35.19 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 514 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 587 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  33.5 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 		 505 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.29 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.72 
 
 		 527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 506 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 500 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.85 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 508 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 490 aa  176  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.45 
 
 		 525 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  32 
 
 		 518 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.92 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.79 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 524 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 		 788 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 478 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 514 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 498 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 463 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 542 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 499 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 763 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>