113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2284 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  83.84 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  82.97 
 
 		 273 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  46.93 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  45.85 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  31.2 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.6 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  30.38 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  30.13 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  30.38 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  30.38 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  30.38 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  29.11 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  29.11 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  26.84 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  26.84 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  26.84 
 
 		 378 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  27.56 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  32.5 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  26.84 
 
 		 864 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  24.34 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  26.41 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  24.57 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  30.21 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  28.46 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  25.1 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  29.18 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.31 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  28.11 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  28.46 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  26.59 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  27.43 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.4 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  26.41 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.03 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  24.2 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.63 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  25.38 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  24.57 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  25.76 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  31.01 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  35.44 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  30.95 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  29.3 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  29.3 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  29.3 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  29.3 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  29.3 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  28.03 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  39.18 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  25.63 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  22.73 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.38 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  23.47 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  23.47 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  24.4 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  38.37 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  27.52 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  28.03 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  23.79 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  28.24 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  26.12 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  24.71 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  23.37 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  23.37 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.95 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  23.21 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.95 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  23.46 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  21.91 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  23.08 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  23.08 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  23.08 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  32.93 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  27.69 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  32.93 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  27.85 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  32.93 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.35 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.35 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.35 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  23.5 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.35 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.35 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  23.47 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  22.54 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.35 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  26.8 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  23.88 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  31.71 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>