36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2276 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  79.81 
 
 		 980 aa  1600    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  45.23 
 
 		 942 aa  763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  100 
 
 		 948 aa  1922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  49.62 
 
 		 919 aa  871    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  45.46 
 
 		 922 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  46.42 
 
 		 943 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  47.34 
 
 		 948 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  46.02 
 
 		 941 aa  778    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  51.43 
 
 		 961 aa  922    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  49.18 
 
 		 970 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  50.22 
 
 		 925 aa  879    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  56.46 
 
 		 953 aa  1054    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  48.75 
 
 		 923 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  46.86 
 
 		 918 aa  754    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  45.04 
 
 		 917 aa  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  45.63 
 
 		 985 aa  804    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  37.46 
 
 		 939 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  34.97 
 
 		 908 aa  561  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  38.98 
 
 		 933 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  38.31 
 
 		 948 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  34.49 
 
 		 917 aa  449  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1002 aa  357  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  66.02 
 
 		 305 aa  333  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  50.32 
 
 		 321 aa  313  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  44.08 
 
 		 262 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  36.69 
 
 		 795 aa  167  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  27.01 
 
 		 764 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 286 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  24.12 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  26.24 
 
 		 282 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  28.93 
 
 		 262 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  30.68 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  26.19 
 
 		 253 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  26.18 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  23.65 
 
 		 258 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 323 aa  45.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>