60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2167 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2167  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1970  protein of unknown function DUF979  91.19 
 
 		 318 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2370  protein of unknown function DUF979  90.88 
 
 		 318 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0320038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0091  hypothetical protein  81.65 
 
 		 316 aa  527  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0066  hypothetical protein  81.96 
 
 		 316 aa  527  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5730  hypothetical protein  69.81 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290991  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0872  hypothetical protein  69.81 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0814549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0226  hypothetical protein  65.41 
 
 		 318 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2907  hypothetical protein  66.88 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0262  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0249  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0006  hypothetical protein  67.09 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.686055 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3372  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2115  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2976  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3307  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0444  hypothetical protein  64.78 
 
 		 318 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0191  hypothetical protein  65.93 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3745  protein of unknown function DUF979  66.25 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.412774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1171  hypothetical protein  56.21 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3593  hypothetical protein  56.21 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1119  hypothetical protein  56.21 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0174836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1218  hypothetical protein  53.33 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2569  protein of unknown function DUF979  54.57 
 
 		 320 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1259  hypothetical protein  54.44 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  normal  0.819314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3290  protein of unknown function DUF979  52.45 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2880  protein of unknown function DUF979  52.24 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0019  putative transmembrane protein  51.55 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1183  protein of unknown function DUF979  50.77 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2012  hypothetical protein  51.25 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279391  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3084  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3117  hypothetical protein  47.63 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0932  putative integral membrane protein  48.6 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2806  permease  47.32 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3098  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2878  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0377318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3116  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00155748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2845  permease  47.32 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3093  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6524  protein of unknown function DUF979  48.41 
 
 		 316 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2870  hypothetical protein  47 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4306  hypothetical protein  51.25 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4060  hypothetical protein  51.25 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3465  hypothetical protein  51.25 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2152  hypothetical protein  47 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4531  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2057  hypothetical protein  43.91 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0956308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3960  hypothetical protein  50.31 
 
 		 316 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3453  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1377  hypothetical protein  43.03 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0578  hypothetical protein  43.03 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0657  hypothetical protein  43.03 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0438  protein of unknown function DUF979  45.71 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2481  hypothetical protein  45.11 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1833  hypothetical protein  40.82 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.407427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1373  hypothetical protein  41.19 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1414  hypothetical protein  40.45 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.488248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1679  hypothetical protein  39.81 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.559939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0176  hypothetical protein  37.34 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1236  protein of unknown function DUF979  35.05 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>