More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2117 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  90.16 
 
 		 252 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  89.75 
 
 		 252 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  69.32 
 
 		 252 aa  348  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 234 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  41.7 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  37.23 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  40.61 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1884  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  37.82 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0899  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  34.95 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0867  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0657  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01480  hypothetical protein  34.03 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0196  hypothetical protein  33.18 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  32.64 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5125  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>