270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2098 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  100 
 
 
345 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  94.75 
 
 
345 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  94.17 
 
 
345 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  73.47 
 
 
354 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  73.76 
 
 
351 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  66.86 
 
 
341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  67.45 
 
 
341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  66.86 
 
 
341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  66.57 
 
 
341 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  67.76 
 
 
350 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  66.37 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  66.67 
 
 
682 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  66.67 
 
 
682 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  66.67 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  67.46 
 
 
350 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  65.69 
 
 
341 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  65.1 
 
 
341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  65.98 
 
 
346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  66.47 
 
 
346 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  67.16 
 
 
357 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  67.26 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  67.68 
 
 
375 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  67.07 
 
 
360 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  65.77 
 
 
350 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  65.66 
 
 
349 aa  427  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  63.77 
 
 
349 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  65.27 
 
 
365 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  64.16 
 
 
355 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  62.54 
 
 
345 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  63.58 
 
 
343 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  63.94 
 
 
341 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  64.72 
 
 
356 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  63.64 
 
 
335 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  58.11 
 
 
339 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  56.62 
 
 
328 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  54.22 
 
 
332 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  56.63 
 
 
338 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  57.01 
 
 
339 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  55.95 
 
 
361 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  57.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  56.05 
 
 
338 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  54.85 
 
 
337 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  58.44 
 
 
315 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  59.21 
 
 
334 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  56.44 
 
 
329 aa  362  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  56.82 
 
 
315 aa  362  7.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  53.78 
 
 
335 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  53.92 
 
 
335 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  53.01 
 
 
336 aa  358  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  55.49 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  56.27 
 
 
318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  54.55 
 
 
315 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  56.33 
 
 
339 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  54.86 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  56.27 
 
 
315 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  55.63 
 
 
317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  55.95 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  51.81 
 
 
335 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  54.98 
 
 
317 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  53.11 
 
 
336 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  54.22 
 
 
347 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  54.22 
 
 
347 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  53.23 
 
 
343 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  55.31 
 
 
317 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  55.62 
 
 
378 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  51.58 
 
 
330 aa  336  5e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  52.73 
 
 
353 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  54.32 
 
 
341 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  56.56 
 
 
328 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  51.85 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  50.62 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  46.49 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  50.92 
 
 
341 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  47.18 
 
 
344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  47.92 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  48.54 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  45.76 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  47.24 
 
 
348 aa  293  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  45.71 
 
 
338 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  43.84 
 
 
346 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  43.36 
 
 
337 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  44.44 
 
 
337 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  40.87 
 
 
355 aa  247  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  40.18 
 
 
364 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.14 
 
 
346 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  40.51 
 
 
352 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  35.03 
 
 
346 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  31.89 
 
 
334 aa  186  7e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.15 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.03 
 
 
353 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  37.01 
 
 
368 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  35.8 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.67 
 
 
354 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  35.62 
 
 
366 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  34.89 
 
 
322 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>