More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2095 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  63.13 
 
 
507 aa  657  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  83.93 
 
 
504 aa  864  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.88 
 
 
516 aa  659  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  69.94 
 
 
500 aa  707  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  63.22 
 
 
526 aa  647  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  70.8 
 
 
498 aa  709  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  83.53 
 
 
504 aa  866  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  63.8 
 
 
528 aa  647  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  63.01 
 
 
543 aa  638  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  100 
 
 
516 aa  1056  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.92 
 
 
520 aa  649  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  64.93 
 
 
507 aa  668  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  63.3 
 
 
527 aa  647  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  63.8 
 
 
528 aa  648  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  65.27 
 
 
505 aa  663  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  64.23 
 
 
523 aa  650  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  62.43 
 
 
515 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  66.07 
 
 
505 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  66.27 
 
 
505 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  66.27 
 
 
505 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  66.07 
 
 
505 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  66.47 
 
 
592 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  66.27 
 
 
505 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  62.1 
 
 
512 aa  611  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  66.07 
 
 
505 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  66.07 
 
 
505 aa  607  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  53.54 
 
 
542 aa  538  1e-152  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  54.55 
 
 
537 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  54.72 
 
 
515 aa  516  1e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  51.64 
 
 
530 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  54.67 
 
 
501 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  52.33 
 
 
518 aa  461  1e-128  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.34 
 
 
506 aa  453  1e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  48.65 
 
 
484 aa  439  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  47.62 
 
 
484 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.2 
 
 
507 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  46.17 
 
 
496 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.2 
 
 
497 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.98 
 
 
493 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  48.55 
 
 
484 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.78 
 
 
507 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.98 
 
 
507 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.52 
 
 
484 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.41 
 
 
484 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.62 
 
 
484 aa  418  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  47.61 
 
 
492 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.17 
 
 
488 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  48.02 
 
 
479 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.83 
 
 
488 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.61 
 
 
492 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  46.9 
 
 
490 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.57 
 
 
492 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.56 
 
 
571 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.76 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.48 
 
 
512 aa  407  1e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.61 
 
 
504 aa  408  1e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.55 
 
 
496 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  47.31 
 
 
485 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  46.19 
 
 
493 aa  399  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.13 
 
 
487 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  46.8 
 
 
496 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  46.67 
 
 
483 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.74 
 
 
481 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  47.58 
 
 
484 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  48.44 
 
 
484 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.87 
 
 
485 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.03 
 
 
485 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.83 
 
 
486 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.3 
 
 
467 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  46.09 
 
 
476 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  42.15 
 
 
494 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.74 
 
 
480 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  40.17 
 
 
480 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  39.41 
 
 
499 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  42.86 
 
 
467 aa  316  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.21 
 
 
484 aa  310  3e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.51 
 
 
468 aa  300  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  40.79 
 
 
461 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.71 
 
 
467 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.46 
 
 
552 aa  275  1e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  32.07 
 
 
1363 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40 
 
 
490 aa  239  6e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.48 
 
 
514 aa  239  7e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.12 
 
 
450 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.86 
 
 
470 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  48.97 
 
 
1387 aa  136  7e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  130  8e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.29 
 
 
157 aa  129  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.75 
 
 
157 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.85 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  44.85 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.85 
 
 
164 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.45 
 
 
164 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.17 
 
 
155 aa  122  2e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  41.98 
 
 
160 aa  121  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.37 
 
 
276 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.79 
 
 
170 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  46.48 
 
 
161 aa  120  8e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.39 
 
 
154 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.29 
 
 
157 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>