138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2083 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  651  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  90.66 
 
 
316 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  91.35 
 
 
316 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  71.75 
 
 
309 aa  469  1e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  80.52 
 
 
332 aa  465  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  71.1 
 
 
312 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  71.1 
 
 
312 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  72.33 
 
 
330 aa  444  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  71.1 
 
 
312 aa  445  1e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  71.29 
 
 
312 aa  445  1e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  70.45 
 
 
312 aa  446  1e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.01 
 
 
312 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  76.95 
 
 
355 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  71.33 
 
 
312 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  73.76 
 
 
313 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  71.88 
 
 
313 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  69.93 
 
 
315 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  70.11 
 
 
309 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  72.36 
 
 
268 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  61.76 
 
 
286 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  59.78 
 
 
289 aa  356  2e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  67.78 
 
 
296 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  67.78 
 
 
296 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  60.71 
 
 
315 aa  355  7e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  61.4 
 
 
310 aa  342  6e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  62.7 
 
 
276 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  57.51 
 
 
325 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  56.3 
 
 
269 aa  321  9e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  56.34 
 
 
270 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  56.88 
 
 
270 aa  313  3e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  56.88 
 
 
270 aa  312  4e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  59.43 
 
 
272 aa  313  4e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  56.02 
 
 
270 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  56.25 
 
 
265 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  55.38 
 
 
266 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  55.28 
 
 
322 aa  305  5e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  53.51 
 
 
270 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  55.86 
 
 
265 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  54.07 
 
 
301 aa  304  1e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  57.09 
 
 
265 aa  303  2e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  56.85 
 
 
280 aa  303  2e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  57.96 
 
 
265 aa  303  4e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  58.65 
 
 
290 aa  301  7e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  52.25 
 
 
290 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  54.47 
 
 
270 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  55.77 
 
 
303 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  56.9 
 
 
268 aa  298  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  56.78 
 
 
283 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  54.09 
 
 
278 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  55.19 
 
 
280 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  54.36 
 
 
280 aa  283  4e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  54.92 
 
 
275 aa  283  4e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  50 
 
 
288 aa  282  5e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  46.42 
 
 
279 aa  282  5e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  49.81 
 
 
277 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  49.8 
 
 
273 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  49.24 
 
 
270 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  49.4 
 
 
273 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  52.42 
 
 
286 aa  274  1e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  50.2 
 
 
273 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  50.83 
 
 
270 aa  272  5e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  52.33 
 
 
273 aa  272  5e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  52.09 
 
 
275 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  50.6 
 
 
265 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  50.2 
 
 
265 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  50.4 
 
 
270 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.65478e-09 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  51.71 
 
 
274 aa  266  3e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  49.8 
 
 
270 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  46.89 
 
 
271 aa  265  9e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  47.7 
 
 
272 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  50.19 
 
 
273 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50.19 
 
 
273 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  50.99 
 
 
267 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  50 
 
 
255 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  46.79 
 
 
265 aa  252  5e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  47.83 
 
 
298 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  50.42 
 
 
275 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  51.87 
 
 
284 aa  244  1e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  43.58 
 
 
289 aa  243  2e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  39.67 
 
 
352 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  44.35 
 
 
300 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  44.13 
 
 
355 aa  232  7e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  37.9 
 
 
374 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  43.51 
 
 
267 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  40.26 
 
 
357 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  38.56 
 
 
374 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
360 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  37.9 
 
 
374 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
360 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  44.4 
 
 
283 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
286 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  9.78439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1160  metallophosphoesterase  42.63 
 
 
352 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5686  metallophosphoesterase  43.25 
 
 
275 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3659  metallophosphoesterase  44.58 
 
 
288 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.0716533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>